后来在甲午战争中又不得不重新组建，最终全军在台湾殉国。
而这一世，黑旗军的命运当然大有不同。
大约在德武四年，左李相继自立，各地汉族地主武装纷纷改弦易帜，唯有两广总督是旗人瑞麟。
他依然效忠清廷，对刘永福部队坚持清剿。
但瑞麟的力量终归有限，因此黑旗军虽然依旧活跃在两广边境，但并没有深入越南，帮助越南抵抗法国人。
而且，两广总督瑞麟的全名是叶赫那拉·瑞麟。
现在已经改名叫做赵瑞麟，跟着赵杏贞翻越高原去抓毛人去了。
因此，两广战局大明几乎是传教而定的。
黑旗军也立刻向大明投诚。
朱富贵对于黑旗军和刘永福很有好感，但是这样的农民军自然是不能保留的。
就像朱富贵很敬仰老将冯子材，但也只是亲自前往广东看望了他一次，邀请他前往凤都养老，遭到拒绝之后也没有挽留。
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